Éric Dupuis détient un doctorat en physique théorique de l'Université de Montréal. Il s'est spécialisé en théorie des champs et dans l'étude des défauts topologiques, particulièrement dans les applications liées aux phases quantiques de la matière.

Chez Ouranos depuis 2022, il fait partie de l'équipe de spécialistes en science du climat, contribuant au développement d'outils d'analyses climatiques et appuyant la recherche et le développement.